音樂學（musicology）是采用科學方法對中外音樂藝術和各種音樂文化現(xiàn)象進行系統(tǒng)研究的一門藝術理論學科，內容主要涉及：音樂的歷史發(fā)展及演變、音樂的社會功能及文化意義、音樂的審美機制和美學規(guī)律、音樂作品的解析和批評、音樂語言的構成及運作、音樂的傳播與接受等方面。
其分支學科在國內目前包括：中國音樂史、西方音樂史、中國傳統(tǒng)音樂理論、音樂分析學、音樂美學、民族音樂學（音樂人類學）、音樂社會學、音樂批評、音樂心理學、音樂教育學、音樂聲學等。
上海音樂學院自1927年創(chuàng)立，是國內歷史最悠久、影響最大的高等音樂學府。
七十余年來（特別是解放以來）為我國乃至世界樂壇培養(yǎng)了大批優(yōu)秀人才，并為中國現(xiàn)代意義上的音樂教學體系、音樂理論系統(tǒng)的形成和發(fā)展做出了突出貢獻。
本院音樂學系于1982年正式建立，由此掀開了本院音樂學學科教學發(fā)展與科研進步的新篇章。
從歷史上溯源，本院的音樂理論學科從1927年建院伊始便開始奠基，以蕭友梅博士、黃自先生為代表的前輩理論家、作曲家奠定了上海音樂學院重視基礎理論、善于融會中西的優(yōu)良學風。
解放初期的1949年，本院便成立了中國最早的音樂理論研究基地“音樂研究室”。
1956年，本院成立民族音樂系，下設理論專業(yè)。
與此同時，作曲系改稱理論作曲系，招收理論專業(yè)學生，進一步加強理論學科的建設。
在這些舉措的推動下，上海音樂學院音樂理論學科的人才培養(yǎng)和學術進步取得了世人矚目的成就。
1979年，“音樂研究室”開始招收音樂學方向的碩士研究生。
1980年本院音樂研究所在原“音樂研究室”的基礎上正式成立，使我院音樂學的學科發(fā)展在改革開放的新形勢下注入新的活力。
音樂學系創(chuàng)立后，堅持以扎實的教學為基礎，以高質量的科研為先導，成績卓著，對全國乃至世界的音樂學發(fā)展產生了積極影響。
幾十年來，我院的音樂學理論事業(yè)立足我國本土的民族民間音樂資源，同時積極汲取外來的優(yōu)秀學術養(yǎng)料，在音樂研究和理論教學的各個領域中均取得了有目共睹的成就，涌現(xiàn)出了沈知白先生、錢仁康先生這樣德高望重、學貫中西的大師級學者。
改革開放以來，以夏野先生、譚冰若先生為代表的老一代著名教授為音樂學系的發(fā)展和開拓做出了卓越的貢獻，陳應時教授的研究成果產生了世界性的廣泛影響，江明教授、劉國杰教授、陳聆群教授、沈旋教授、黃白教授、錢亦平教授、黃允箴教授等均被公認是各自專業(yè)領域中的權威專家。
近年來，音樂學系不斷拓展教學方向和研究范圍，形成了涵蓋三年制博士、三年制碩士、五年制本科以及留學生、進修生等多專業(yè)、多層次的完備教學體系，整體水平在全國音樂學界處于領先地位，部分學科處在國際先進地位。
畢業(yè)生遍布全國各音樂和藝術院所、大學、媒體和出版社，很多人已經成為音樂事業(yè)發(fā)展的骨干人才。
作為上海市教委大力投入建設的重點學科，音樂學系師資力量雄厚，科研成果累累，多次獲得國家、教育部、文化部和上海市的多項教學與科研獎項。
目前，我系骨干教師承擔了國家級、部級、市級和院級等各類科研課題數(shù)十項，并在全院教學改革中發(fā)揮著領頭軍的作用。
隨著已在海內外先后獲得博士學位的青年學人如楊燕迪、洛秦、趙維平、孫國忠、陶辛、韓鍾恩等骨干教師的不斷成熟，音樂學系的人才梯隊狀況已呈優(yōu)化態(tài)勢，保證了我系的傳統(tǒng)優(yōu)勢學科（如中國音樂史、西方音樂史、中國傳統(tǒng)音樂理論、音樂分析）和新興學科（流行音樂、音樂人類學、東方音樂、歌劇研究、音樂美學等）在國內處于領先地位。
我系重視對外學術交流，近十多年間，陸續(xù)邀請來自世界各地的幾十名著名音樂學者進行專題講學與討論，活躍了學術氣氛并開闊了視野。
與此同時，一些骨干教師獲得了來自英國、荷蘭、日本、德國、美國和港澳臺方面的邀請和資助，分別在這些國家和地區(qū)進行講學、合作研究和學術考察。
此外，改革開放以來，我系接受和培養(yǎng)了來自美、英、日、法、德、意、荷、韓、新加坡以及香港、臺灣等國家與地區(qū)的多名留學生（包含大學本科、碩士研究生、博士研究生各個層次），在弘揚和傳播祖國優(yōu)秀音樂遺產的同時，也促進了海內外的文化交流。
音樂學系現(xiàn)有教學和研究方向為：中國古代音樂史、中國近現(xiàn)代音樂史、中國傳統(tǒng)音樂理論、西方音樂史、作品分析、外國作曲家與作品研究、音樂美學、音樂人類學、通俗音樂研究、東方音樂研究、和聲風格分析、音樂劇研究、音樂文獻編譯等。
學科領域覆蓋面之廣在國內音樂院校的音樂學系中首屈一指。