南京大學醫(yī)學院的前身為中央大學醫(yī)學院，創(chuàng)建于1935年，1949年解放后改名為南京大學醫(yī)學院，1951年劃歸部隊系統(tǒng)，1987年經(jīng)教育部(原國家教委)批準重建，成為教育部直屬的第一所綜合性大學七年制醫(yī)學院。2012年入選教育部卓越醫(yī)生培養(yǎng)計劃-拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)計劃，開始試辦八年制醫(yī)學教育，目標是培養(yǎng)杰出的領(lǐng)導(dǎo)型臨床學家和醫(yī)學科學家，辦學理念和人才培養(yǎng)獨具特色。
現(xiàn)設(shè)臨床醫(yī)學(八年制)、基礎(chǔ)醫(yī)學(七年制)和口腔醫(yī)學(七年制)三個專業(yè)?，F(xiàn)有臨床醫(yī)學和基礎(chǔ)醫(yī)學一級學科博士點、口腔醫(yī)學一級學科碩士點和臨床醫(yī)學博士后流動站，其中普通外科學為國家重點學科，臨床醫(yī)學為江蘇省重點學科。美國科技信息所的ESI數(shù)據(jù)庫最新統(tǒng)計結(jié)果顯示：醫(yī)學院臨床醫(yī)學學科進入全球排名前1%，是南京大學11個進入全球前1%的學科之一。
以南京鼓樓醫(yī)院、南京軍區(qū)南京總醫(yī)院(金陵醫(yī)院)和南京口腔醫(yī)院作為附屬醫(yī)院，并以南京市各?？漆t(yī)院作為教學醫(yī)院，師資力量雄厚，現(xiàn)有中國工程院院士2人，博士生導(dǎo)師56人，教授151人，副教授220人。近三年獲國家科技進步一等獎1項、二等獎1項，獲教育部高等學?？萍歼M步一等獎5項、二等獎2項。近三年獲國家重大科研項目8項，國家自然科學基金204項，總累計科研經(jīng)費約1.7億元。
除了學校的各類獎、助學金外，本院專設(shè)有“吳階平基金會優(yōu)秀貧困大學生助學專項基金”和“校友助學專項基金”等助學金，資助品學兼優(yōu)、家境貧寒的學生完成學業(yè);還專設(shè)有“香港孫明杰基金會威爾曼優(yōu)秀研究生獎學金”，獎勵優(yōu)秀研究生。
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